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TMB

| 产品背景及介绍

肿瘤突变负荷(Tumor Mutation Burden,TMB) 定义为一份肿瘤基因组中,所评估基因的外显子编码区每兆碱基中发生置换和插入/缺失突变的总数。TMB水平越高,代表着肿瘤细胞中能被免疫系统识别的肿瘤新抗原数量可能越多,因此TMB可以作为潜在生物标志物来预测免疫治疗的疗效。

菁良基因配对TMB质控品来源于同一病人样本的肿瘤细胞和白细胞,细胞经过传代培养后,按照一定比例混合制成FFPE,gDNA, ctDNA质控品。之后会进行WES测序,计算配对样本TMB值,及进行ddPCR验证,验证样本是否满足混合比例需求。同时,我们还可以提供不同产品形式的检测限质控品。

| 产品特点

高度模拟病人样本的细胞来源质控品

gDNA/FFPE蜡块/ctDNA等丰富的产品形式

经过多家行业顶级检测公司测试,结果稳定一致

提供成对质控品用于过滤胚系突变

提供完整的WES 测序数据、TMB参考值及生信流程

配对质控品TMB值覆盖3到23多个梯度

可提供ddPCR验证突变频率的检测限质控品

| 产品应用

相应分子诊断检测实验质控品

优化和验证新的实验流程或试剂盒

检测实验方法的灵敏度,准确度和特异性

比较各平台的检测差异

| 产品信息

产品形式(定制):gDNA、ctDNA、FFPE蜡块

产品规格(定制):根据客户需求定制

突变检测方法:WES及数字PCR(PCR可选)

| 产品内容

菁良基因目前可提供11对配对TMB质控品(TMB值从3到23不等),及1个单样本的TMB质控品(TMB值为28);菁良基因也可以提供上述样本不同比例的混合样本,以得到更多的TMB质控品。

| 测序参数

测序策略:全外显子组测序(WES)

WES捕获芯片:IDT xGen Exome Research Panel v1.0(39M)

WES测序平台:Illumina HiSeq X Ten

WES数据质量:有效测序深度大于500X

| 基本流程

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