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菁良基因助力mNGS在新生儿感染中的应用

宏基因组二代测序 (metagenomics next‑generation sequencing,mNGS)平台是基于高通量测序技术对各种临床样本中的全部生物基因组进行测序的实验室诊断技术,近年来已逐渐被认识并应用于各种感染性疾病的诊断。
长期以来新生儿感染一直是儿科医生面临的重大挑战,基于mNGS具有无偏倚性、覆盖广、敏感性高,用时相对较短等优点,尤其可在混合感染或病毒感染方面展现其优势,因此mNGS在新生儿感染性疾病中具有广阔的应用前景

图1  新生儿重症监护病房感染性疾病患儿送检宏基因组二代测序流程

注:a呼吸道感染优先选择肺泡灌洗液,再考虑痰液和鼻咽拭子样本;b推荐 DNA 测序作为血流感染的检测方法,RNA 病毒感染不除外的情况推荐 RNA 测 序;对于呼吸道感染,同时进行 RNA 和 DNA 测序;对于中枢神经系统感染,在排除病毒感染的情况下,优先进行 DNA 测序;当怀疑病毒感染或临床表现复杂,无特定怀疑方向时,可同时进行RNA和DNA测序
mNGS技术通过对临床样本中微生物和宿主核酸的测序分析,可以无偏倚地检测多种病原微生物,正在逐渐应用于临床感染性疾病病原检测,然而业界对该技术的临床适应证、实验流程、质量管理、性能验证和报告解读等方面仍有困惑。作为分子检测标准品研发生产商,菁良也有一系列mNGS质控解决方案。

菁良mNGS质控解决方案

菁良基因定制宏基因组测序质控品,可包含一种或多种细菌真菌类微生物,并有菌液,核酸溶液等多种产品形式可选。客户可根据检测需求,定制包含不同种类微生物,不同产品形式,不同规格等的质控品。
产品可定制内容

产品应用
注册报证:试剂盒内阳性质控品,企业参考品
日常质控:评估检测流程稳定性,可靠度,一致性,再现性
平行测试:室间质评,试剂盒平行比较,测试平台比较
生信评估:生信建模及流程测试,流程开发
参考文献:
[1]   中华医学会儿科学分会新生儿学组, 中华儿科杂志编辑委员会. 宏基因组二代测序技术在新生儿感染性疾病中的临床应用专家共识 [J] . 中华儿科杂志, 2022, 60(6) : 516-521
[2]   中华医学会检验医学分会临床微生物学组, 中华医学会微生物学与免疫学分会临床微生物学组, 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物与感染分会. 宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识[J]. 中华检验医学杂志, 2021, 44(2):14


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